Известный русский учёный, краевед, исследователь Пётр Иванович Кёппен, который первым ввёл в научный оборот план крепости Алустон, в 1830 и в 1833 годах впервые упомянул о ремонте оборонительных сооружений башен Алустона.
В трудах учёного о ремонте башен Алустона первой была упомянта прямоугольная башня — Орта-Куле, размер которой 12 м х 12,5 м, толщина стен — 2,75 м -2,85 м, высота — 8 м. Через прямоугольную башню генуэзцами были проведены в крепость линию водопровода. Орта-Куле имеет интересный архитектурный элемент — противтаранный скос (талус), Талус укреплял башню и защищал ее нижний этаж от удара таранов. Кроме защиты от таранов, скосы-талусы использовались для сброса с башни больших камней или ядер на голову штурмующих противников. По закону отражения, настилочная траектория рикошета камней, падавший на талус вертикально, могла перекрывать зону до 25-30 м вглубь.
Следующей башней крепости Алустон, которая нуждалась в ремонте 1836 года стала Чатал-Куле (Рогатая башня) — шестиугольная башня, она стояла на северном направлении и прикрывала ворота, которые вместе с ней были разобраны на строительный материал. Размер Чатал-Куле был 12 м х 12 м. Сверху шестиугольная башня имела парапет с зубцами на навесных кронштейнах. Башня Чатал-Куле, утраченная к настоящему времени почти полностью, традиционно считается и изображается шестигранной, причём с такой же конфигурацией внутреннего пространства.
В 1863 году для предупреждения несчастных случаев принимается решение разобрать верхнюю часть шестигранной башни Чатал-Куле, находившуюся на небезопасном расстоянии от мечети. Одновременно, «для обеспечения нормального существования» средней башни, в которой обнаружилась давняя трещина, рекомендовано устройство «контрфорса с задней стороны высотою примерно в две-трети вышины всей стены». После удаления верхней части башни Чатал-Куле, в 1871 или 1872 году, оставшаяся часть оборонительного сооружения окончательно разрушилась. До наших дней шестигранная башня не сохранилась.
В конце ХIX века известным купцом, меценатом и коллекционером Николаем Дмитриевичем Стахеевым были пожертвованы денежные средства для восстановления, укрепления и ремонта оборонительных сооружений башен Алустона. Благодаря пожертвованиям Николая Дмитриевича нынешнее состояние крепости Алустон во многом сохранилось до сегодняшнего дня.